校长办公室是学校行政的综合管理、统筹协调机构和学校对外联系的重要窗口。主要职责包括：

1、组织全校性行政会议、重大活动、公务接待的协调和安排工作；

2、负责校务会议的组织和安排，督促检查重要文件、重要决议、重大决策及领导重要批示的执行情况；

3、负责学校行政文稿、重要文件、校领导重要讲话等起草撰写工作；

4、负责上级来文的收发和归档、学校行政公文的管理，指导各行政部门、单位的公文处理工作；

5、负责校领导公务活动安排和以学校名义进行的联系、接待和拓展工作；

6、负责统筹推进依法治校工作，为学校各单位提供政策法律咨询和指导，为学校重大决策、重大经济活动提供法律意见，对重大合同开展合法性审查；负责协调处理学校仲裁、诉讼等法律事务；

7、负责学校行政印章、事业单位法人证书的管理和使用，维护学校校名、校徽及学校声誉等无形资产；

8、负责群众来信来访工作，安排校领导接待日，负责“校长信箱”的管理，及时协调处理相关事宜；

9、统筹学校办公自动化建设、使用和维护工作；协调教育部、教育厅专线视频会议，负责学校会议室的管理和统筹；

10、负责学校信息公开工作，管理维护学校信息公开网；做好《中国药科大学年鉴》的编纂；

11、负责全校综合统计工作，协调各行政部门对外报送专项统计数据；

12、负责学校综合档案的归档、管理及信息化建设工作。

完成上级部门和学校领导交办的其它工作。